Sinds 1992 is Christine verbonden als fluitdocente aan de Biltse Muziekkamer. Vanaf 1997 doceert zij bij Harmonievereniging Crescendo in Sassenheim en heeft ze een particuliere lespraktijk aan huis in Amsterdam. Tijdens haar studie speelde Christine in het Regionaal Jeugdorkest, later het Jeugdorkest Nederland. Met dit orkest gaf zij concerten door heel Europa. Daarnaast legde zij zich toe op kamermuziek.

Christine maakte deel uit van verschillende ensembles, waaronder Het Amsterdams Fluitkwartet, waarmee ze o.a. op verscheidene Staatsiebanketten in het Koninklijk Paleis op de Dam speelde.
Momenteel speelt Christine in Het Nederlands Fluitorkest, waarmee ze concerten geeft in binnen- en buitenland. Met dit orkest werkte ze samen met Sexteto Canyengue en Mathilde Santing.
Ook treedt ze regelmatig op als freelance musicus bij verschillende ensembles.
Door regelmatig leerlingenuitvoeringen te organiseren kan Christine van Rooijen haar ervaringen als uitvoerend musicus optimaal combineren met haar docentschap.